大數據將會(huì )給醫學(xué)界帶來(lái)怎樣的影響?怎樣將基礎醫學(xué)研究中的成果應用于臨床實(shí)踐? 怎樣從臨床實(shí)踐推動(dòng)基礎研究?隨著(zhù)信息技術(shù)在醫學(xué)研究中的應用,臨床醫學(xué)、生物學(xué)、信息學(xué)又發(fā)生了一次交叉融合,形成了生物醫學(xué)信息學(xué)(Biomedical Informatics)。
醫療信息系統面臨的最大挑戰是減少系統數據和功能的冗余,并尋求復雜業(yè)務(wù)環(huán)境下不同數據結構、不同系統架構的應用系統的互通互聯(lián)技術(shù),形成一個(gè)高效的、靈活的、可識別的系統集。一個(gè)高質(zhì)量、高水準、整合臨床數據與基礎研究數據的信息系統是轉化醫學(xué)的核心和實(shí)現從“實(shí)驗臺到病床”轉化的關(guān)鍵。這一信息系統應包括三大部分:去除個(gè)人信息的臨床數據中心(De-Identified Clinical Data Repository, d-CDR)、組學(xué)數據庫及分析平臺、合乎科研設計要求的各種病例標本和正常對照標本資源庫。
臨床數據采集、存儲、管理和應用相關(guān)的醫療信息技術(shù)已成為21世紀醫療衛生服務(wù)的支撐技術(shù)。在以提高醫療服務(wù)質(zhì)量和控制醫療服務(wù)成本(或服務(wù)于臨床科學(xué)研究)為目的的醫療信息化工程中,個(gè)性化的臨床數據采集和強化的醫療工作流控制之間存在這“不可調和”的矛盾??蒲须娮硬v通過(guò)與醫院的PACS、HIS、EMR和LIS系統對接,自動(dòng)或半自動(dòng)地填寫(xiě)相關(guān)數據表單,可以大幅度提高數據的準確性和工作效率?,F有醫療信息系統中依然有大量非常重要的臨床數據只存在于自由文本形式的文檔和報告中。醫學(xué)自然語(yǔ)言處理技術(shù)成為了生物醫學(xué)信息學(xué)研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。對于英文環(huán)境的醫療文本的自動(dòng)處理研究在國外已開(kāi)展多年,并有部分成果進(jìn)入商業(yè)應用。面向中文病歷文檔的自動(dòng)處理技術(shù)的研究卻很少有報道。中文醫學(xué)語(yǔ)言處理技術(shù)是臨床信息化中關(guān)鍵的基礎技術(shù)之一。
以樣本庫為中心的臨床科研信息平臺可擴展到多個(gè)相聯(lián)的信息系統,包括:科研電子病例系統、隨訪(fǎng)信息管理系統、實(shí)驗室信息管理系統、生物信息分析平臺、組學(xué)數據庫、藥物臨床試驗信息平臺等。這些信息系統的建立是轉化醫學(xué)的基礎之一,在研究與臨床應用之間架起了一道不可或缺的橋梁。