全球知名的工業(yè)物聯(lián)網(wǎng)解決方案提供商研華科技近日宣布發(fā)布與偉薩科技技術(shù)共同創(chuàng )建的DNA基因排序加速解決方案。該解決方案解決了大中華區和北美地區對非侵入性產(chǎn)前檢查(NIPT)和癌癥和疾病診斷市場(chǎng)日益增長(cháng)的需求。
“下一代測序(NGS)”是近年來(lái)備受關(guān)注的基因技術(shù)。通過(guò)比較和分析DNA序列,NGS根據人類(lèi)基因組數據庫精確定制治療方案。NGS通過(guò)定位存儲與潛在原因相關(guān)的信息來(lái)幫助醫療人員防止傳播和感染,對抗癌癥和罕見(jiàn)疾病。然而,產(chǎn)生了一個(gè)問(wèn)題,基因服務(wù)提供者面臨著(zhù)越來(lái)越大的挑戰:處理無(wú)休止的基因組數據。這個(gè)耗時(shí)耗力的過(guò)程阻礙了研究和進(jìn)展。
為了應對這一挑戰,研華科技與偉薩科技,一家專(zhuān)長(cháng)在基因組測序加速的臺灣公司,共同開(kāi)發(fā)了一種加速解決方案。通過(guò)將研華SKY-7210服務(wù)器與偉薩科技的FPGA卡相結合,專(zhuān)為精密醫療行業(yè)設計出一種優(yōu)化和加速數據處理的基因測序一體式服務(wù)器。
借助這個(gè)高速平臺,種系分析管道處理時(shí)間最多可縮短25小時(shí),從近33小時(shí)縮短到不足8小時(shí),從而大大提高了效率并降低了TCO(總經(jīng)營(yíng)成本)。該基因排序加速解決方案現在已經(jīng)在研究機構、生物庫、診所和醫院開(kāi)始使用,在基因組數據分析方面提供了更大的靈活性,并提升了精確醫學(xué)的價(jià)值。
基因排序加速解決方案
基因排序加速解決方案提供一個(gè)無(wú)痛的升級過(guò)程,使用本地BWA-MEM和GATK處理種系管道的二次分析。使用者可以在不更改工作流的情況下完成對齊、排序、標記復制和變量調用的分析。隨著(zhù)本機快速算法的加速,SNPs和INDELs的整體精度為99.9%,與原始軟件相同。此外,加速解決方案提供與原始軟件完全相同的輸出文件格式。
基因排序加速解決方案為在服務(wù)器上部署大數據和深度學(xué)習提供了一個(gè)平臺,該服務(wù)器具有3TB DDR4插槽、3 x NMC(網(wǎng)絡(luò )夾層卡)和2 x 300W GPU或6 x 150W GPU,以減少從HDD到FPGA的數據移動(dòng)延遲。連接更靈活,更容易適應未來(lái)的擴展。
【關(guān)于研華】
研華科技成立于1983年,以“智能地球的推手”作為品牌愿景,專(zhuān)注在工業(yè)物聯(lián)網(wǎng)和智慧城市產(chǎn)業(yè),提供軟硬件整合解決方案。研華業(yè)務(wù)分布全球26個(gè)國家,擁有近8,000名員工,以強大的技術(shù)服務(wù)及營(yíng)銷(xiāo)網(wǎng)絡(luò ),為客戶(hù)提供本土化響應的便捷服務(wù)。同時(shí),研華智能系統推出“IPC+N+S”策略,深化行業(yè)應用解決方案,集結產(chǎn)業(yè)伙伴之力,積極打造合作、共贏(yíng)的物聯(lián)網(wǎng)生態(tài)圈,加速物聯(lián)網(wǎng)應用落地。